Tighe también ha manifestado que antes de que Cruise se uniera, John Travolta era considerado "el cienciólogo más dedicado". A esto se le une que en 2008 Cruise recibió una medalla de valor, la condecoración más alta dentro de 'Scientology'. Los enfrentamientos entre los intérpretes se han analizado en todos los medios, llegando a confundir los hechos reales con historias inventadas. La revista Star afirmaba en 2015 que entre ambos existía un romance y que habría sido Travolta quien inició a Cruise en su religión. Esta versión ha ido perdiendo fuerza con el paso del tiempo, y algunos exintegrantes de la Cienciología afirman que Tom Cruise "se acercó solo".
"Cuando se reunió con Miscavige no estaba en buena forma, espiritual o mental. Estaba personalmente muy desequilibrado", Lawrence Wright sobre Cruise en su libro 'Going Clear'. En dicha publicación se sacan a la luz algunos de los entresijos de esta "secta". "Miscavige decía que Tom era la única persona, además de él, en la que confiaría para dirigir la iglesia", explica Wright en su escrito. Y continúa diciendo: "Miscavige convenció a Cruise de que ellos eran 'los únicos' de un puñado de 'grandes seres' en el planeta".
Tom Cruise le quita el puesto
John Travolta no habría recibido nunca tanta importancia como su compañero, ni siquiera los mismos beneficios. A pesar de ello, nunca se ha atrevido a desligarse de 'Scientology' por miedo a que su verdad salga a la luz. "Él se sentía muy intimidado sobre las posibles filtraciones y me lo dijo", explicó un ex miembro de alto rango a Time en 2001.